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io.github.bigbio.external : jmztab

Maven & Gradle

Aug 18, 2021
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jmztab: Java library to read Tab-delimited for proteomics quant data · JmzTab is a Java-based library to read mzTab files containing peptide/protein quantitative data

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  1. Download JD-GUI to open JAR file and explore Java source code file (.class .java)
  2. Click menu "File → Open File..." or just drag-and-drop the JAR file in the JD-GUI window jmztab-3.0.13.jar file.
    Once you open a JAR file, all the java classes in the JAR file will be displayed.

uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.utils

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.utils.MZIdentMLUtils.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.utils.MzIdentMLUnmarshallerAdaptor.class - [JAR]

uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.MZTabFileParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.MZTabFileValidator.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.MZTabProperties.class - [JAR]

uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.COMLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.MTDLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.MZTabDataLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.MZTabHeaderLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.MZTabLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PEHLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PEPLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PRHLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PRTLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PSHLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PSMLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.PositionMapping.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.SMHLineParser.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.parser.SMLLineParser.class - [JAR]

uk.ac.ebi.pride.jmztab.model

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.AbundanceColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Assay.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.AssayQuantificationMod.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.CV.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.CVParam.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.CVParamOptionColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.ColUnit.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Comment.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Contact.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.FixedMod.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.IndexedElement.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Instrument.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZBoolean.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabColumnFactory.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabConstants.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabDescription.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabFile.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabRecord.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MZTabUtils.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Metadata.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MetadataElement.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MetadataProperty.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MetadataSubElement.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Mod.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Modification.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.ModificationList.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.MsRun.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.OptionColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.PSM.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.PSMColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.PSMSearchEngineScore.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Param.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Peptide.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.PeptideColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.PeptideSearchEngineScore.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Protein.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.ProteinColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.ProteinSearchEngineScore.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Publication.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.PublicationItem.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.QuantificationReagent.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Reliability.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Sample.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.SearchEngineScore.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Section.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.SmallMolecule.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.SmallMoleculeColumn.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.SmallMoleculeSearchEngineScore.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.Software.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.SpectraRef.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.SplitList.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.StudyVariable.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.UserParam.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.model.VariableMod.class - [JAR]

uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.ConvertFilesRun.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.ConvertMZidentMLFile.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.ConvertProvider.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.ConverterCVParam.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.DynamicMZTabFile.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.DynamicMZTabFileRun.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.DynamicMetadata.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.MZTabCommandLine.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.MZTabFileConverter.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.ModParam.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.QuantitationCVParam.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.SearchEngineParam.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.convert.SearchEngineScoreParam.class - [JAR]

uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.CrossCheckErrorType.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.FormatErrorType.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.LogicalErrorType.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabConversionException.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabError.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabErrorList.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabErrorOverflowException.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabErrorType.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabErrorTypeMap.class - [JAR]

├─ uk.ac.ebi.pride.jmztab.utils.errors.MZTabException.class - [JAR]

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