View Java Class Source Code in JAR file
- Download JD-GUI to open JAR file and explore Java source code file (.class .java)
- Click menu "File → Open File..." or just drag-and-drop the JAR file in the JD-GUI window Genotype-IO-1.0.3.jar file.
Once you open a JAR file, all the java classes in the JAR file will be displayed.
org.molgenis.genotype.variant.sampleProvider
├─ org.molgenis.genotype.variant.sampleProvider.CachedSampleVariantProvider.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.sampleProvider.SampleVariantUniqueIdProvider.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.sampleProvider.SampleVariantsProvider.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.sampleProvider.SwappingSampleVariantsProvider.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.variantFilter
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.RandomAccessGenotypeDataVariantQc.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantCombinedFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterBiAllelic.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterIsSnp.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterIterable.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterIterator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterMachR2.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterSeq.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterSeqPos.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterableGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantFilterableGenotypeDataDecorator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantIdIncludeFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variantFilter.VariantQcChecker.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.examples
├─ org.molgenis.genotype.examples.BasicUsage.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.examples.Compare2TrityperDatasets.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.examples.FilteringSamplesAndVariants.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.trityper
├─ org.molgenis.genotype.trityper.TriTyperAlleleAnnotation.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.trityper.TriTyperGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.trityper.TriTyperGenotypeWriter.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.variant.range
├─ org.molgenis.genotype.variant.range.GeneticVariantRange.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.range.GeneticVariantRangeSubIterable.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.range.GeneticVariantRangeSubIterator.class - [JAR]
org.molgenis.vcf
├─ org.molgenis.vcf.VcfInfo.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.VcfReader.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.VcfRecord.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.VcfRecordReader.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.VcfSample.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.vcf
├─ org.molgenis.genotype.vcf.VcfGeneticVariantMeta.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.vcf.VcfGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.vcf.VcfGenotypeRecord.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.vcf.VcfVariantLineMapper.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.util
├─ org.molgenis.genotype.util.Cache.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.CalledDosageConvertor.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.ChrPos.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.ChromosomeComparator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.FixedSizeIterable.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.GenotypeCountCalculator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.GenotypeDataCompareTool.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.Ld.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.LdCalculator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.LdCalculatorException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.MachR2Calculator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.MafCalculator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.MafResult.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.ProbabilitiesConvertor.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.RecordIteratorCreators.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.util.Utils.class - [JAR]
org.molgenis.genotype
├─ org.molgenis.genotype.AbstractGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.AbstractRandomAccessGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.Allele.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.Alleles.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeDataException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeDataIndex.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeFileType.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeInfo.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeLoader.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypeWriter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.GenotypedDataWriterFormats.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.RandomAccessGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.RandomAccessGenotypeDataReaderFormats.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.RawLineQuery.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.RawLineQueryResult.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.Sample.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.Sequence.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.SimpleSequence.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.VariantQuery.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.VariantQueryResult.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.oxford
├─ org.molgenis.genotype.oxford.BgenGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.oxford.GenGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.oxford.GenGenotypeWriter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.oxford.HapsGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.oxford.HapsGenotypeWriter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.oxford.OxfordSampleFile.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.oxford.OxfordSampleFileWriter.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.annotation
├─ org.molgenis.genotype.annotation.Annotation.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.annotation.CaseControlAnnotation.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.annotation.SampleAnnotation.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.annotation.SexAnnotation.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.annotation.VcfAnnotation.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.multipart
├─ org.molgenis.genotype.multipart.IncompatibleMultiPartGenotypeDataException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.multipart.MultiPartGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.multipart.MultiPartSequencesIterable.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.multipart.MultiPartVariantsIterable.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.plink.readers
├─ org.molgenis.genotype.plink.readers.MapFileReader.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.plink
├─ org.molgenis.genotype.plink.BedBimFamGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.BedBimFamGenotypeWriter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.FormatPlinkChr.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.PedMapGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.PedMapGenotypeWriter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.PlinkFileParser.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.PlinkSampleAnnotations.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.plink.drivers
├─ org.molgenis.genotype.plink.drivers.MapFileDriver.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.drivers.PedFileDriver.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.plink.datatypes
├─ org.molgenis.genotype.plink.datatypes.MapEntry.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.plink.datatypes.PedEntry.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.snpeff
├─ org.molgenis.genotype.snpeff.SnpEffAnnotationTranslator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.snpeff.SnpEffEffect.class - [JAR]
org.molgenis.vcf.meta
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMeta.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaAlt.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaContig.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaEntry.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaFormat.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaInfo.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaParser.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaPedigree.class - [JAR]
├─ org.molgenis.vcf.meta.VcfMetaSample.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.editable
├─ org.molgenis.genotype.editable.EditableGenotypeDosageSampleVariantsProvider.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.editable.EditableSampleVariantsProvider.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.editable.GenotypeDataCustomVariantProvider.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.editable.GenotypeDataEditableProbabilities.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.editable.VariantInformation.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.table
├─ org.molgenis.genotype.table.TableGenotypeWriter.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.modifiable
├─ org.molgenis.genotype.modifiable.GenotypeModificationException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.modifiable.ModifiableGeneticVariant.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.modifiable.ModifiableGeneticVariantIterator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.modifiable.ModifiableGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.modifiable.ModifiableGenotypeDataInMemory.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.sampleFilter
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.ConvertToSampleFilterIterable.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.ConvertToSampleFilterIterator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleCombinedFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleFilterableGenotypeData.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleFilterableGenotypeDataDecorator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleFilteredReadOnlyGeneticVariant.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleIdIncludeFilter.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.sampleFilter.SampleIncludedFilter.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.variant.id
├─ org.molgenis.genotype.variant.id.BlankGeneticVariantId.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.id.GeneticVariantId.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.id.ListGeneticVariantId.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.id.SingleGeneticVariantId.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.variant
├─ org.molgenis.genotype.variant.AbstractGeneticVariant.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GeneticVariant.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GeneticVariantChrPosComparator.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GeneticVariantMeta.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GeneticVariantMetaMap.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GenotypeRecord.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GenotypeRecordGt.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GenotypeRecordMap.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.GenotypeRecordProb.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.IllegalReferenceAlleleException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.NotASnpException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.ReadOnlyGeneticVariant.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.ReadOnlyGeneticVariantTriTyper.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.variant.VariantLineMapper.class - [JAR]
org.molgenis.genotype.tabix
├─ org.molgenis.genotype.tabix.TabixFileNotFoundException.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.tabix.TabixIndex.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.tabix.TabixQuery.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.tabix.TabixQueryResult.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.tabix.TabixRawLineQuery.class - [JAR]
├─ org.molgenis.genotype.tabix.TabixRawLineQueryResult.class - [JAR]
