View Java Class Source Code in JAR file
- Download JD-GUI to open JAR file and explore Java source code file (.class .java)
- Click menu "File → Open File..." or just drag-and-drop the JAR file in the JD-GUI window genotype-1.4.0.jar file.
Once you open a JAR file, all the java classes in the JAR file will be displayed.
org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.CombinedOutputLayerInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.CombinedOutputLayerRefInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.HomozygousInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.HomozygousPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.SingleGenotypeInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.SingleGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.SortingCountInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.predictions.TrueGenotypeOutputLayerInterpreter.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.learning
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.GenotypeTrainingArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.TrainModelG.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.mappers
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.CeilingNormalizationMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.CombinedLabelsMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.CombinedLabelsMapperRef.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.CountReorderingMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.CountSortingLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeFeatureMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperLSTM.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperLSTMAllStrands.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV1.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV10.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV11.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV12.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV13.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV14.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV15.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV16.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV17.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV18.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV19.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV2.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV20.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV20FixRef.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV21.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV22.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV23.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV24.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV25.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV26.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV27.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV28.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV29.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV3.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV30.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV31.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV32.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV33.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV34.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV35.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV36.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV37.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV38.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV4.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV5.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV7.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV8.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.GenotypeMapperV9.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.HomozygousLabelsMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.InverseNormalizationMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.IsIndelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.MatchesReferenceMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.MetaDataLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.NaiveNumAlleleMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.NumDistinctAllelesLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.OneSampleMapperUnsortedV1.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.OneSampleMapperUnsortedV2.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.OriginalGobyCountIndexMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.RecordCountSortHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.RecordCountSortingLabelMapperImpl.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SegmentMetaDataLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleBaseFeatureMapperV1.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleBaseGenotypeMapperV1.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleBaseLabelMapperV1.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleBaseMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleGenoTypeCountMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleGenotypeLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SingleReadIndexCountMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SoftmaxLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SomaticFeatureMapper1.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.SomaticFeatureMapper2.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.TrueGenotypeLSTMDecodingFeatureMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.TrueGenotypeLSTMLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.mappers.VariantTypeMapper.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.CombinedGenotypeAssembler.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.FeedForwardDenseLayerAssembler.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.GenotypeAssembler.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.GenotypeSegmentsLSTM.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.GenotypeSixDenseLayersNarrower2.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.GenotypeSixDenseLayersWithIndelLSTM.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.GenotypeSixDenseLayersWithIndelLSTMAggregate.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.NumDistinctAlleleAssembler.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.architecture.graphs.SoftmaxAlleleLabelAssembler.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.performance
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.AccuracyHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.AccuracySegmentAccumulator.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.AlleleAccuracyHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.BEDHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.GenotypeTrainingPerformanceHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.GenotypeTrainingPerformanceHelperWithAUC.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.IndelAccuracySegmentAccumulator.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.SegmentGenotypePredictionTest.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.SegmentPerformanceMetricDescriptor.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.SegmentStatsAccumulator.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.SegmentTrainingPerformanceHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.performance.StatsAccumulator.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.GenotypeDomainDescriptor.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.GenotypeSegmentDomainDescriptor.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.NumDistinctAllelesInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.NumDistinctAllelesOutputLayerPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.SegmentMetaDataInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.learning.domains.SoftmaxGenotypeInterpreter.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.segments
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.FillInFeaturesFunction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.FormatterCountHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.MyFillInFeaturesFunction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.PostProcessSegmentFunction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.RecordList.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.Segment.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.SegmentAdapter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.SegmentHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.SegmentLabelMapper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.SegmentUtil.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.SingleCandidateIndelSegment.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.SnpOnlyPostProcessSegmentFunction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.WithIndelsPostProcessSegmentFunction.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.helpers
├─ org.campagnelab.dl.genotype.helpers.AddTrueGenotypeHelper.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.helpers.GenotypeHelper.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.storage
├─ org.campagnelab.dl.genotype.storage.SegmentReader.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.storage.SegmentWriter.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.segments.splitting
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.splitting.NoSplitStrategy.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.splitting.SingleCandidateIndelSplitStrategy.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.segments.splitting.SplitStrategy.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.tools
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.AddTrueGenotypes.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.AddTrueGenotypesArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.AddTrueGenotypesMultiThreaded.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.DebugGenotype.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.DebugGenotypeArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.DownSampleGenotypeArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.DownSampleGenotypes.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.FeatureNameArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.FeatureNamePrinter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.GenotypeShowArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.PredictG.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.PredictGArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.PrintSSIToText.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.PrintSSIToTextArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.RemoveSnpsGenotypes.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.RemoveSnpsGenotypesArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SBISimulator.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SBISimulatorArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SBIToSSIConverter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SBIToSSIConverterArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SSIQuickWriter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SSIQuickWriterArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SSIRandomizer.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SSIRandomizerArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SbiStats.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SbiStatsArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.SegmentTrainingArguments.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.ShowG.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.tools.TrainModelGS.class - [JAR]
org.campagnelab.dl.genotype.predictions
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.AbstractGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.AggregatedSoftmaxGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.CombinedGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.CombinedOutputLayerPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.CombinedWithIsVariantGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.DLGenotypePredictor.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.GenotypeModel.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.GenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.GenotypeProtoPredictor.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.IsVariantInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.IsVariantPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.MetaDataInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.MetadataPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.NumDistinctAlleleGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.NumDistinctAlleleWithIsVariantGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.SegmentGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.SegmentMetaData.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.SegmentPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.SegmentPredictionInterpreter.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.SoftmaxGenotypePrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.TrueGenotypeOutputLayerPrediction.class - [JAR]
├─ org.campagnelab.dl.genotype.predictions.TrueGenotypePrediction.class - [JAR]
